Microbiology Laboratory Turkey

Mikrobiyoloji Ile Ilgili Tüm Konuların Kısa ve Öz Anlatımları. Microbiology Lab Information.

Bu Blogda Ara(SEARCH)

MicroLab

biyoloji etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
biyoloji etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

16 Şubat 2019 Cumartesi

Şubat 16, 2019

AMORF ÜRAT KRİSTALİ

AMORF ÜRAT KRİSTALİ

Sedimentte Görünümü:
Sarı-pembe- turuncu (tuğla rengi) renktedir.
60C'de veya alkali idrarda sarı- kırmızı granüler şekilde görülür.

Karıştığı Yapılar ve Ayrımı:
Diğer kristaller (Özellikle amorf fosfat kristali ile. Kimyasal testlerle doğrulanmadıkça ayrımı zordur)

Normali:  
İdrarda normalde bulunabilir.

Patolojisi:
Klinikle uyumlu görülmesi patolojik sayılabilir.

Nedenleri:  
  • Yüksek ateş
  • Sıvı kaybı





INSTAGRAM
4
By on 4 yorum:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , ,

7 Şubat 2019 Perşembe

Şubat 07, 2019

KREATİNİN NEDİR (KREATİNİN TESTİ)

KREATİNİN

Kısaltma: CREA.
Kullanım Amacı: 
Böbreklerin filtrasyon fonksiyonunun değerlendirilmesi ve takibi amacıyla kullanılır.



 Genel bilgiler:
∎ Kasların enerji metabolizmasında rol oynayan, yüksek enerjili fosfat bileşiklerinden kreatin’in ve kreatin fosfat’ın spontan şekilde, nonenzimatik bir reaksiyon sonucunda yıkılmasıyla ortaya çıkan bir artık üründür. Molekül ağırlığı 113 daltondur. Fosfokreatin’in kreatin’e dönüşümü kas kontraksiyonu sırasında ihtiyaç duyulan enerjinin önemli bir kısmını sağlar. Kas dokusunda mevcut kreatin’in %1-2 kadarı her gün yıkılarak kreatinin’e dönüşür. Bu sebeple serum konsantrasyonu kas kitlesinden ve kas aktivitesinden etkilenir. Anca yine de stabil koşullarda, üretilen miktarının günler arası farkı azdır.

 ∎ Başlıca atılım yolu böbrekler olduğundan böbreklerin süzme fonksiyonunun değerlendirilmesinde en fazla kullanılan analiz parametresidir. Bütün vücut sıvılarında birbirine yakın konsantrasyonlarda bulunur. Plazma proteinlerine bağlanmaz. Glomerüler filtrasyon yoluyla ultrafiltrata geçen kreatin’in tübüler reabsorbsiyonu yoktur. Buna karşılık az bir kısmı tübüler sekresyon yoluyla atılır. Bu sebeple, kreatinine dayanılarak yapılan hesaplamalarda glomerüler filtrasyon hızı gerçek değerin %10-20 kadar üzerinde bulunur. Renal fonksiyon bozukluğuna bağlı olarak serum kreatinin konsantrasyonunun yükseldiği durumlarında, aktif sekresyonla atılan kreatinin miktarında artış olması, glomerüler filtrasyon hızının gerçek değerden biraz daha yüksek hesaplanmasına sebep olur. Simetidin ve trimetoprim gibi ilaçlar, kreatin’in tübüler sekresyonunu azaltarak, özellikle ağır renal fonksiyon bozukluğu durumlarında, glomerüler filtrasyon hızının daha doğru bir şekilde hesaplanmasını sağlayabilir. Çünkü kreatinin sekresyonunun olmaması durumunda, kreatinin inülin’e benzer bir davranış gösterir. Ancak pratik uygulamada böyle bir yola başvurulma ihtiyacı duyulmaz.
∎ Kronik böbrek yetmezliğinin erken dönemlerinde, böbrek fonksiyon kaybının izlenmesi açısından yalnızca serum kreatinin konsantrasyonunun ölçümü yeterince hassas bir test değildir. Böbrek fonksiyon bozukluğu kuşkusu olduğu durumlarda veya diabet, hipertansiyon, kardiyovasküler hastalık gibi kronik böbrek yetmezliği gelişme riskini artıran hastalığı olanlarda, yalnızca serum kreatinin konsantrasyonu ölçümü yerine kreatinin klirensinin dikkate alınmasının daha yararlı olacağı bildirilmektedir.


Test Sonucunun Yorumu:
⧐ Herhangi bir nedene bağlı akut veya kronik renal fonksiyon bozuklukları (intrensek böbrek hastalıkları, perfüzyon yetersizliği, postrenal obstrüksiyon vb.) serum kreatinin konsantrasyonunda yükselmeye neden olur.

 ⧐ Aktif akromegali, jigantizm, hipertiroidizm de serum kreatinin konsantrasyonunun yükselmesine neden olur.

 ⧐ Diyetten üreye göre daha az da olsa etkilenir. Tüketilen et miktarının artışı, kreatinin üretiminde ve dolayısıyla serum kreatinin konsantrasyonunda bir miktar artışa sebep olabilir. Simetidin ve trimetoprim gibi ilaçların kullanılması, glomerüler filtrasyonu etkilemeksizin, tübüler sekresyonu azalttığından, serum kreatinin konsantrasyonunda geçici yükselmeye sebep olabilir.

 ⧐ Kas kitlesi ve aktivitesi azalmış uzun süreli yatalak hastalarda, kas kitlesi azalmış ileri safhadaki müsküler distrofilerde ve gebelikte serum kreatinin konsantrasyonu düşük bulunabilir.


Numune: Serum (kırmızı veya sarı kapaklı tüp). Minimum 500 μL.
Çalışma yöntemi: Otoanalizör, kolorimetrik.

Referans Aralığı:












INSTAGRAM
0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , , ,

26 Ocak 2019 Cumartesi

Ocak 26, 2019

Riketsiyalar (Riketsiya) (Rickettsia)

Riketsiyalar (Riketsiya)

Riketsiyalar küçük, Gram-negatif, kok veya çubuk şeklinde olup genişlikleri 0,3-0,7 mikrometre, uzunlukları da 1-2 mikrometredir. Bir istisna dışında zorunlu hücre içi paraziti olup konukçu hücre yokluğunda kültür edilememiştir. Bu nedenle bazı kaynaklarda virüs ve bakteri arası geçiş formu olarak bildirilmiştir.

Riketsiyaların Genel Özellikleri 
Riketsiyalar, insanlarda hastalıklara sebep olur.Tüm dünyada yaygın bulunmalarına karşılık farklı coğrafi bölgelerde değişik cinsleri bulunur. İnsanlara sindirim sistemlerinde parazit olarak yaşadıkları bit, pire, kene ve akar gibi eklembacaklılar tarafından bulaştırılır. 

Riketsiyaların sebep olduğu hastalıklara riketsiyoz adı verilir. Dünyanın değişik coğrafi bölgelerinde farklı riketsiyozlar görülür. Ülkemizin de yer aldığı Akdeniz Bölgesi’nde, Avrupa ve Afrika’da en sık Marsilya ateşi hastalığı görülür. Riketsiyozlar, ateşle seyreden klinik tablolara yol açar. En iyi bilinen türü Rickettsia ricketsii’dir. 



Riketsiyaların Virüs ve Bakterilerden Farkı 
Riketsiyaların yer aldığı gruptaki mikroorganizmalar, küçük olmaları ve gram boyama ile iyi boyanmamaları, ökaryotik hücrelerin sitoplazmalarında yaşamlarını sürdürebilmeleri nedeniyle önceleri virüs sanılmışlardır ancak yapısal olarak gram negatif çubuklara benzerlikleri, DNA, RNA, enzim, ribozom içermeleri ve antibiyotiklerle inhibe edilmeleri nedeniyle bakteriler sınıfında yer almıştır. Bu özellikleri ile virüslerden ayrılmaktadır. 

Riketsiyalar bakteriler gibi normal besiyerlerinde üretilemez. Zorunlu hücre içi paraziti oldukları için embriyolu yumurta sarısında, hücre kültürlerinde veya deney hayvanlarında üretilebilir. Bu özellikleri ile bakterilerden ayrılmaktadır.



INSTAGRAM
0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , , ,

19 Ocak 2019 Cumartesi

Ocak 19, 2019

Kan Lipitleri (Kan Yağları) Kolesterol Trigliserid

Kan Lipitleri (Kan Yağları) 
Kolesterol Trigliserid

Suda çözünmeyip, eter, kloroform ve benzen gibi polar olmayan çözücülerde çözünen maddelerdir. Lipidler tüm canlılarda bulunur, çünkü hayatın devamlılığı için gereklidir. Lipidler katı yağları, mumları ve onlarla ilişkili bileşikleri kapsarlar. Vücutta genellikle ya membran lipidleri ve yağ hücrelerinde trigliserit olarak bulunurlar, ya da lipoprotein partikülleri olarak proteinler ile birlikte plazmada taşınırlar. 

Diyetle alınan yağın %98‟i trigliserid, geriye kalanı ise fosfolipid, kolesterol, kolesterol esteri, serbest yağ asidleri, yağda eriyen vitaminler, steroidler ve terpenlerdir.


Kolesterol
Hayvansal kökenli bir steroiddir. Bu nedenle lipidler gibi eter ve kloroformda erir. Kolesterol endojen ve eksojen kaynaklı olabilir, çekirdekli hücrelerce sentezlenebilir. Sentezde en aktif olan organlar karaciğer, adrenal korteks, yumurtalıklar, testisler ve bağırsak epitelyum hücreleridir. 

Kolesterol, insan diyetinde düşük miktardadır ( 1 g/ gün). Bazı lipoproteinlere katılarak plazmada perifer dokulara taşınır ve oralarda hücre membranlarının en büyük bileşeni olabilir. Diyetteki kolesterol %0.05 oranında bulunduğunda karaciğer, ince bağırsak ve adrenal bezler kolesterolün % 80‟ini sentez ederler, buna karşılık diyet % 2 kolesterol içerdiğinde endojen kolesterol üretimi, %10- 30‟a düşer. Bu durumda karaciğer sentezi inhibe edilir. Bağırsakta kolesterol sentezi kolesterolden ziyade safra asitleri tarafından inhibe edilir. Kolesterolün yaklaşık yarısı safra tuzlarına çevrildikten sonra feçes ile atılır. 


➤Kolesterolün Serumda Arttığı Durumlar 
o Esansiyel hiperkolesterolemi 
o Şeker hastalığı 
o Hipotiroidizm 
o Tıkanma sarılığı 
o Gebelik

➤Kolesterolün Serumda Azaldığı Durumlar 
o Hepatik dejenerasyon 
o Hipertiroidizm 
o Yetersiz beslenme


Trigliseridler (TG) 
Gliserolün üç tane hidroksil grubu ile yağ asitlerinin oluşturdukları esterlerdir. Bu yapıdan dolayı yağlara; trigliseritler ya da triaçil gliserol denir. 

Trigliseridler, yağ asitlerinin başlıca depo şeklidir. Eğer gliserolün her üç –OH grubuna aynı yağ asidi bağlanmış ise basit trigiserid; yağ asitlerinden biri farklı ise bileşik (karma) trigliserid adı verilir. 

Trigliseridler yağ dokusunda büyük lipid damlacıkları halinde saklanırlar. Trigliseridler yağ hücresi içinde veya lipoprotein partikülü üzerinde hidroliz edildiği zaman, enerji kaynağı olarak kullanılmak üzere serbest yağ asidleri açığa çıkar. Trigliseridler, önemli biyolojik fonksiyonlara sahiptirler.

Plazma trigliseridleri yaş, cinsiyet ve bilhassa diyet ile ilgili olarak değişiklik gösterir. Karaciğer, yağ asitleri ve gliserolden endojen trigliserid sentezinde önemlidir. Sentezlenen trigliseridler VLDL ile plazmada yağ depolarına doğru taşınır.

Yağ Asitleri 
Daha çok düz zincirli monokarboksilik asitlerdir. Bunlar başlıca diyet trigliseridlerinden kaynaklanır. Yağ asitleri glikoza alternatif ya da onun yerine geçebilecek bir enerji kaynağı olarak rol oynar.


Fosfolipidler 
Trigliseridlere benzer yapıdadırlar ancak, onlardan daha çok komplekstir. Üç yağ asidinden bir polar baş grup tarafından doldurulur. Polar ve apolar gruplara sahip olması fosfolipidlere deterjan özelliği kazandırır. Fospolipidler başlıca karaciğerde ve ince bağırsakta sentezlenir. Bunlar hücrelerin en önemli üyelerinden biridir. Hücre membranında her zaman bulunur.




INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER



0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , , , ,

16 Ocak 2019 Çarşamba

Ocak 16, 2019

Jelatin Hidroliz Testi

Jelatin Hidroliz Testi

Bu test, mikroorganizmaların, jelatini hidrolize eden jelatinase enzim sentez yeteneğini ölçmede kullanılır. Bakterilerin identifikasyonunda yararlanılır. Jelatin, protein karakterinde bir madde olup kollagenin hidrolizasyonundan elde edilir. Büyük moleküllü olduğundan bakteri, hücre duvarından geçemez. Bu nedenle daha küçük moleküllere katalize edilir; bunu ekstra sellüler bir enzim olan jelatinase yapar. Jelatinase tarafından proteinlerin katabolizması iki aşamalıdır.

Uzun süre yüksek ısıda bulanan jelatin kısmen hidrolize olur ve katılaşma özelliğini kaybeder.


Testin Yapılış Tekniği; 
  • İncelenecek bakteri kolonisinden iğne öze ile alınıp dik olarak jelatinli besiyerine ekim yapılır. 
  • Tüpler, 37°C’de 15 gün kadar inkube edilir. 
  • Bu süre sonunda kontrollerle birlikte buzdolabı sıcaklığında 1-2 saat bırakılır. 
  • Erimenin olup olmadığına dikkat edilir. Jelatinin hidrolize edildiği durumlarda, buzdolabından çıkarılınca, jelatinli ortamın sıvı halinde ve katılaşmadığı görülür (pozitif jelatin hidrolizasyonu). Negatif durumlarda tüpteki sıvı jelatinli besiyeri katılaşır.



INSTAGRAM
0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , ,

11 Ocak 2019 Cuma

By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , ,

10 Ocak 2019 Perşembe

Ocak 10, 2019

İmmersion Objektifiyle İnceleme (İmmersiyon Yağı)

 İmmersion Objektifiyle İnceleme
(İmmersiyon Yağı)


İmmersiyon objektifi ile çalışmada preparat ile objektif arasına sedir yağı konur. Sedir yağının kırılma (refraksiyon) indeksi (1,535) lamınki ile yakın değerde olduğundan kondansatörden gelerek lamdan geçen ışınlar tekrar kırılmadan sedir yağından düz olarak geçerek objektiften içeri girerler. Eğer sedir yağı kullanılmazsa preparat ile objektif arasında hava bulunacaktır ki bunun kırma indeksi 1 olduğundan lamdan geçen ışık, objektife girmeden tekrar yanlara doğru kırılacak ve objektife az ışık girecektir. Bu da iyi ve net bir görüntü sağlamaz. Sedir yağı kullanılınca çok daha aydınlık bir saha elde edilir. Sedir yağı gibi kullanılabilecek diğer sıvılar arasında balsam (1,524), euparal (1,483), gliserol (1,460) ve su (1,334) vardır.





İmmersiyon objektifi ile inceleme aşamaları aşağıda açıklanmıştır. 
  • Kuru objektifle preparat incelemesi yapılır. 
  • Kuru objektifte inceleme yapılırken immersiyon objektifi ile incelenmek istenen yer görüntü alanının ortasına getirilir. 
  • Preparat üzerinde incelenecek bölgeye bir damla immersiyon yağı damlatılır. 
  • İmmersiyon objektifi ışık yolu üzerine getirilir. 
  • Tablanın kenarından bakılarak makro ayar vidası yardımıyla immersiyon objektif ucunun yağa temas etmesi sağlanır. 
  • Okülerden bakılarak makro ayar vidası çok yavaş olarak çevrilip görüntü bulunur. 
  • Mikro ayar vidası ile görüntü netleştirilir. 
  • Şaryo ile preparat hareket ettirilip farklı görüş alanları incelenirken diğer elle de mikro ayar vidası ile netlik sağlanır. 
  • İnceleme bittiğinde makro ayar vidası ile tabla en alt seviyeye indirilir. 
  • İmmersiyon objektifi ışık yolundan uzaklaştırılır. 
  • Preparat çıkarılarak dezenfektan çözeltisi içerisine atılır. 
  • Mikroskop usulüne uygun olarak temizlendikten sonra plastik veya kumaş bir örtü ile örtülür ya da kutusuna yerleştirilir.








0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , ,

5 Aralık 2018 Çarşamba

Aralık 05, 2018

ARB Boyama

ARB Boyama

Bazı bakteri türleri hücre duvarlarındaki farklı özelliklerinden dolayı asitlere karşı daha dirençlidirler. Aside dirençli bakterilerin hücre yapısında diğer bakterilere göre daha fazla lipit bulunur. Ayrıca hücrenin etrafında balmumumsu bir tabaka vardır. Tüberküloz, lepra basili, nokardialar ve diğer mikobakteriler bu gruba girer. 


Aside dirençli bakteriler diğer boyama yöntemleri ile kolay boyanamazlar. Boyanmaları için fenollü ve yoğun boya eriyiklerinin uzun süre ya da sıcaklık etkisi ile uygulanması gerekir. ARB boyama tüberküloz (verem) hastalığının tanısında en hızlı, ucuz ve pratik bir yöntemdir.
Preparat hazırlama aşaması, personel ve çevreyi korumak için güvenlik kabini içinde yapılmalıdır. Hazırlanan preparat korunaklı bir yerde kurutulmalı, tespit işleminden sonra da basilin canlı kalabileceği unutulmamalıdır.


ARB boyamada yaygın olarak kullanılan üç farklı yöntem vardır: İkisi karbol fuksin esaslı olan “Ziehl-Neelsen” ve “Kinyoun” boyama, üçüncüsü ise “florokrom” boyamadır. Florokrom boyama daha duyarlı ve daha az zaman alıcı bir yöntem olmakla birlikte, daha pahalı laboratuvar donanımı (floresan mikroskop ve boyalar) ve tecrübeli personel gerektirmesi nedeniyle sınırlı olanaklara sahip laboratuvarlar için pek uygun değildir. Ayrıca Florokrom boyama yöntemi ile pozitifliği saptanan örneklerde de EZN boyama yöntemi ile teyit edilmesi önerilmektedir. 

Ehrlich Ziehl-Neelsen (EZN) ve Kinyoun yöntemlerinde birinci boya olarak karbol fuksin, zıt boya olarak metilen mavisi kullanılır. Bu nedenle aside dirençli hücreler mavi zeminde pembe-kırmızı renkte görünürler.
EZN boyama metodu, ARB boyama yöntemlerinden en sık kullanılanıdır. EZN boyama yönteminde aşağıdaki işlemler sırasıyla uygulanır: 

  • Bakteri kültürü ile preparat hazırlanır (yayma, kurutma ve tespit). 
  • Preparatlar boya sehpası üzerine dizilir. Preparatlar arasında belirli bir aralık bırakılmalıdır. Preparatların birbiriyle temas etmesi çapraz kontaminasyona yol açabilir. 
  • Preparatın üzerine bütün lamı kaplayacak şekilde karbol fuksin boya solüsyonu damlatılır. 
  • Preparat alttan 5 dakika boyunca ısıtılır (Isıtma işlemi, bunzen beki veya pamuklu tel ile yapılabilir. Bunun için yaklaşık 30 cm uzunluğundaki bir telin ucuna pamuk sarılır ve bastırılarak sıkılaştırılır. Pamuk alkole batırıldıktan sonra yakılır, lamların altlarında gezdirilerek ısıtma işlemi gerçekleştirilir. Isıtma öyle olmalıdır ki boyadan buhar çıkmalı ama kesinlikle kaynamamalıdır. Lamın üstünde buharlaşmadan dolayı boyasız yer görülürse hemen boya ilave edilmelidir.) 
  • Preparatların soğuması beklenir. Soğuyunca üzerindeki boya akıtılır. Preparatlar sudan geçirilerek geride kalan boya artıkları uzaklaştırılır. 
  • Preparat asit-alkol karışımı ile dekolorize edilir (Preparatların üzeri asit-alkol ile kaplanır, bir süre bekletildikten sonra asit-alkol akıtılır, preparat sudan geçirilir. Bu işlem boya akmayıncaya kadar ‘en fazla 3 dakika’ sürdürülür. Preparatlar üzerinde kalan fazla su akıtılarak maksimum düzeyde uzaklaştırılır.) 
  • Tekrar boyama sehpasına koyulan lamların üzeri metilen mavisi ile kaplanır. 1 dakika beklenir. 
  • Boya dökülür ve distile su ile yıkanır. 
  • Havada (Kurutma sehpasına dizilerek) kurutulur ve mikroskopta incelenir. Aside dirençli bakteriler pembe-kırmızı renkte, diğer mikroorganizmalar ise mavi renkte görülürler. Preparatlar tamamen kurumadan incelemeye alınmamalıdır. Boyanmış preparatlar, aside dirençli basillerin renginin solmaması için güneş ışığından korunmalıdır. 


INSTAGRAM


0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , ,