Microbiology Laboratory Turkey

Mikrobiyoloji Ile Ilgili Tüm Konuların Kısa ve Öz Anlatımları. Microbiology Lab Information.

Bu Blogda Ara(SEARCH)

MicroLab

katalaz testi etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
katalaz testi etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

23 Ekim 2018 Salı

Ekim 23, 2018

STAPHYLOCOCCUS SPP. (TÜRKÇE)

STAPHYLOCOCCUS SPP.

Staphylococcuslar hareketsiz, sporsuz, genellikle kapsülsüz, gram pozitif (+) bakterilerdir. Mikroskobik incelemede; yuvarlak koklardan oluşmuş Staphylococcus hücreleri, üreme sırasında birbirinden ayrılmayıp 3 boyut yönünde çoğaldıklarından üzüm salkımına benzer kümeler halinde görünür. 

Üreme Özellikleri 
Staphylococcuslar fakültatif anaerobdur. Optimal üreme ısıları 37oC, optimal pH'ları 7.27.4'tür. Kuruluğa, ısıya, çeşitli antiseptik ve dezenfektanlara birçok bakteriye göre daha  dayanıklıdır; ancak kristal viyole ve malaşit yeşili gibi boyalara hassastır. Adi besiyerinde kolay ürer. Bu besiyerlerine kan ve glikoz ilavesiyle bakterinin üremesi artar. Bu tür ortamlarda S tipi koloni oluşturur. Koloniler, üreme ortamında renkleri ile ayrıcalık gösterir ve bazı Staphylococcusların oluşturduğu pigmentin rengini alır. 
Staphylococcus aureus on Blood Agar

➤ İnsanlarda enfeksiyona neden olan başlıca Staphylococcus türleri şunlardır; 
➧ Staphylococcus aureus, en çok enfeksiyona neden olan patojen türüdür. 
➧ Staphylococcus epidermidis, üst solunum yolu ve derinin florasında bulunur; vücut direnci düştüğünde fırsatçı enfeksiyonlara neden olur. 
➧ Staphylococcus saprophyticus, normal florada bulunmaz. Vücut direnci düştüğünde başta üriner sistem enfeksiyonları olmak üzere fırsatçı enfeksiyonlara neden olur. 
Antijenik Özellikleri 
Staphylococcuslar, antijen yapıları bakımdan kesin bir özellik göstermez. Staphylococcus aureus'un tiplendirilmesinde faj tiplendirmesi kullanılır. Gerektiğinde serolojik tiplendirmelerden de yararlanılır. 
Staphylococcus aureus’un Toksin ve Enzimleri 
  • Hemolysin; eritrositleri hemoliz eden toksindir. 
  • Lökosidin; lökositleri öldürücü etki gösteren, fagositozu önleyen toksindir. 
  • Nekrotoksin; dokuları öldürücü etki gösteren toksindir. 
  • Fibronilizin; fibrini eritip bakteriyi hapsolmaktan kurtaran toksindir. 
  • Enterotoksin; besin zehirlenmesine neden olan toksindir 
  • Plazma koagülaz enzimi; pıhtılaşması önlenmiş kanın plazmasını pıhtılaştıran ve patojenliği gösteren bir enzimdir. 
  • Hyalüronidaz enzimi (yayılma faktörü); bakterinin doku içinde yayılmasını sağlayan enzimdir. 
  • Penisilinaz enzimi; penisilinin yapısını bozarak etkisini ortadan kaldıran enzimdir. 
  • Jelatinaz enzimi; jelatini eriten enzimdir. 

Yaptığı Hastalıklar 
➨Deri Enfeksiyonları; apse, fronkül (çıban), sivilce, impetigo (iltihaplı deri enfeksiyonu), kan çıbanı, hordeolum (arpacık), paronişya (dolama), yara, yanık ve cerrahi yara enfeksiyonları.  
➨Solunum Yolu Enfeksiyonları; anjin, akut veya kronik farenjit, sinüzit, otitis media, stafilokok pnömonisi. 
➨Ürogenital Sistem Hastalıkları; piyelonefrit, salpenjit, otitis media, endometrit, servisit, böbrek apseleri. 
➨Sinir Sistemi Hastalıkları; menenjit, artrit, osteomyelit, besin zehirlenmesi ve sepsis yapar. 

Laboratuvar Teşhisi  
İnceleme örnekleri: Balgam, cerahat, BOS, kan . 
Teşhis yöntemleri 
➧Mikrobiyolojik örneğin direkt mikroskobik incelemesi; direkt preparat hazırlanıp gram boyasıyla boyanarak mikroskopta incelenir. 
➧Kültür; kanlı agara ekim yapılarak üreyen bakterinin koloni ve hemoliz özellikleri incelenir. İzole edilen bir Staphylococcusun Staphylococcus aureus olup olmadığı; jelatinli besiyerine ve chapman besiyerine ekim yapılarak belirlenir. 
➧Biyokimyasal testler; katalaz ve koagülaz testleri yapılır. 

INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER

30 Eylül 2018 Pazar

Eylül 30, 2018

ÜRE TESTİ (UREASE TEST)

ÜRE TESTİ (UREASE TEST)

Bu test, bakterilerin üreyi hidrolize eden üreaz (urease) enzimini belirlemek amacıyla yapılır. Bu bakteriler, üreaz enzim aktiviteleri ile üreyi parçalayarak karbondioksit ve amonyak oluşturur. Oluşan alkali ortamda, besiyerinin pembeye dönmesine neden olur.
Testte Christensen’in üre içeren besiyerleri (üreli buyyon veya agar) kullanılır.

Proteus mirabilis ve Klebsiella üreaz pozitif Escherichia coli negatif bakterilerdir.




Testin yapılış tekniği;

➨ Mikroorganizma kültürlerinden, petri kutusu veya tüpteki Christensen’in üreli agar yüzeyine tekniğine uygun ekim yapılır. 
➨ Etüvde, 37°C’de 1-5 gün inkübe edilir. 
➨ Renk değişmelerine dikkat edilerek her gün kontrol edilir. (Bazı durumlarda renk değişikliği 5-6 saat içinde meydana gelebilir.) 
➨ Kolonilerde veya tüpte pembe rengin meydana gelmesi pozitif reaksiyonu gösterir. 
Negatif durumda renk değişikliği olmaz.  



Üre Testi Pozitif Bakteriler

  1. Proteus spp
  2. Corynebacterium spp
  3. Helicobacter pylori
  4. Brucella spp


INSTAGRAM

FACEBOOK

28 Eylül 2018 Cuma

Eylül 28, 2018

IMVIC TEST

IMVIC TEST
(İNDOL, METİLEN KIRMIZISI, SİTRAT, VOGES TEST)


İndol Testi 

İndol, IMViC test grubu içinde yer alan testlerden biridir. IMViC testi; Indol, Metil kırmızısı, Voges - proskauer ve Sitrat (Citrat) testlerinin ilk harflerinden oluşur. Vi 'deki "i" küçük harf olarak yazılır ve sadece okuma kolaylığı sağlar. Bu testler, koliform grup bakterilerin (enterik bakterilerin) ayrımı için kullanılır. 

İndol testi; bakterilerin, bir aminoasit olan triptofanı ayrıştırarak indol meydana getirebilme yeteneğini belirlemek için kullanılır. Aynı zamanda, bakterilerin cins ve tür ayrımında kullanılır. İndol, bakterilerde bulunan triptofanaz enzimiyle bir aminoasit olan triptofanı parçalanması ve hidrolize etmesi sonucu oluşan nitrojenli bir bileşiktir ve aldehidlerle reaksiyona girdiğinde, kırmızı renkli bir ürün oluşturur. Salmonella’da indol pozitif, Proteus mirabilis’de negatiftir.

Testin yapılış tekniği; 
↱ İncelenecek bakteri kolonisinden özeyle alınarak temiz bir tüp içinde bulunan triptofan bulunan bir sıvı besiyerine ekim yapılır (buyyon veya peptonlu su)
↱ Tüpler etüvde, 37oC’de 1-5 gün inkübasyona bırakılır. 
↱ İnkübasyondan sonra üzerine, tüpün kenarından yavaşça akıtmak suretiyle 0,5 ml kovaks ayıracı ilave edilir ve tüp çalkalanır. Kovaks yerine Ehrlich ayıracı da kullanılabilir. 
↱ Renk değişimi gözlenir; 1-2 dakika içinde besiyerinin üst kısmında, parlak kırmızı bir halka oluşması, testin pozitif olduğunu (indol formasyonunu), sarımsı halka ise testin negatif olduğunu (indol oluşmadığını) gösterir.


Metil Kırmızısı Testi 

Metil kırmızısı testi, besiyerinde bakterilerin glukozu fermente edip organik asit oluşturarak besiyerinin pH'ını düşürme (4.4'ün altına) esasına dayanır. Bu test, bakterilerin cins ve türlerinin ayırt edilmesinde kullanılır. Metil kırmızısı testinde; Escherichia coli’de pozitif, Klebsiella pneumoniae’da negatiftir. 

Testin yapılış tekniği; 
➤ İncelenecek bakteri kolonisinden öze ile alınarak Glukoz-Fosfat Broth besiyerine ekim yapılır. 
➤ Tüpler etüvde, 37oC’de 1-7 gün inkübasyona bırakılır. 
➤ İnkübasyondan sonra üzerine 4-5 damla metil kırmızısı ayıracı damlatılır ve iyice karıştırılır. 
➤ Besiyerinde; kırmızı renk oluşması testin pozitif olduğunu, sarı renk oluşması ise testin negatif olduğunu gösterir.
➤ Metil kırmızısı ayıracı; pH 4.4 ve altında kırmızı renk, pH 6.0 ve üzerinde ise sarı renk verir. 


Sitrat Testi 

Bazı bakteriler karbon-enerji kaynağı olarak sitrat kullanır. Sitrat testi, bakterinin tek karbon kaynağı olarak sitratı kullanıp kullanmadığını, aynı zamanda bakterinin cins ve türlerini belirlemek için yapılır. Bakteriler tarafından sitratın metabolizması, citritase veya citrate demolase adı verilen enzimleriyle gerçekleşir. Klebsiella pneumoniae’da sitrat pozitif, Escherichia coli’de negatiftir. 

Testin yapılış tekniği;
➣ İncelenecek bakteri kolonisinden iğne öze ile alınarak tüpteki Simon’s Sitrat Yatık Agar besiyerinin yüzeyine ekim yapılır. 
➣ Tüpler etüvde, 37oC’de 2-7 gün inkübasyona bırakılır. 
➣ İnkübasyon sonunda, orijinal rengi yeşil olan ve indikatör olarak %0,2’lik Bromo timol mavisi kullanılan besiyerinde, besiyerinin rengi maviye dönüşür ve pozitif olarak değerlendirilir.


Voges - Proskauer (VP) Testi 

Bu test, bakteri türlerini belirlemede kullanılır. Bazı bakteriler, glikozu parçalayarak nötral bir ürün olan asetil metil karbinol (acetoin) oluşturur. Nöral ürünler identifikasyonda önemli göreve sahiptir. Asetil metil karbinol, potasyum hidroksid (KOH) varlığında okside olarak diasetil meydana getirir. Bu ürün ise alfa naftol (kreatin, arginin veya kreatinin) ile reaksiyona girdiğinde kırmızı renk oluşturur. Klebsiella pneumoniae’da pozitif, Escherichia coli’de negatiftir. 

Testin yapılış tekniği; 
⟹ İncelenecek bakteri kolonisinden öze ile alınarak tüpteki Glukoz-Fosfat Broth besiyerine ekim yapılır. 
⟹ Tüpler etüvde, 37oC’de 1-7 gün inkübasyona bırakılır. 
⟹ İnkübasyondan sonra üzerine, 1 ml %40’lık KOH, daha sonra 3 ml %5’lik alfa naftol ilave edilir ve karıştırılır. 
⟹ Besiyerinin hava ile temas etmesi için kuvvetli çalkalandıktan sonra 2-5 dakika içinde pembe-kırmızı renk oluşması testin pozitif olduğunu gösterir.


IMViC TEST 

INSTAGRAM

FACEBOOK

27 Eylül 2018 Perşembe

Eylül 27, 2018

CATALASE TEST

CATALASE TEST

Catalase is the enzyme that breaks down hydrogen peroxide (H2O2) into H2O and O2. The oxygen is given off as bubbles in the liquid. The catalase test is primarily used to differentiate between gram-positive cocci. Members of the genus Staphylococcus are catalase-positive, and members of the genera Streptococcus and Enterococcus are catalase-negative.



Performing The Catalase Test


1. Grow the isolate(s) to be tested for 18-24 hours on a BAP at 35-37°C with ~5% CO2 (or in a candle-jar). 

2. From overnight growth on the BAP, use a disposable loop to carefully remove a colony and place it on a glass slide. • Do not transfer any of the blood agar to the slide as erythrocytes in the blood agar will cause a false-positive reaction. 

3. Add 1.0 ml of 3% H2O2 to the slide and mix with the bacteria. 

• H2O2 can be obtained from a commercial drug store. 
• After initially opening, store H2O2 at 4°C in a tightly closed bottle as it will slowly lose potency once opened. 

4. Observe the bacterial suspension on the slide immediately for vigorous bubbling. 

5. It is essential to use a known positive and negative quality control (QC) strain. A Staphylococcus spp. strain can be used for a positive control and a known S. pneumoniae strain or any other streptococcal spp., i.e., S. pyogenes can be used for a negative control.



Reading the catalase test results 

• The absence of bubbling from a transferred colony indicates a negative test. 
• Any bubbling from a transferred colony indicates a positive test.

Procedure of Catalase test (Slide Test)

  1. Transfer a small amount of bacterial colony to a surface of clean, dry glass slide using a loop or sterile wooden stick
  2. Place a drop of 3% H2O2 on to the slide and mix.
  3. A positive result is the rapid evolution of oxygen (within 5-10 sec.) as evidenced by bubbling.
  4. A negative result is no bubbles or only a few scattered bubbles.
  5. Dispose of your slide in the biohazard glass disposal container.

Tube Catalase Test
  1. Add 4 to 5 drops of 3% H2O2 (Hydrogen peroxide) to in a test tube
  2. Using a wooden applicator stick, collect a small amount of organism from a well-isolated 18- to 24-hour colony and place into the test tube (Note: Be careful not to pick up any agar (esp if using Blood Agar).- Explanation in precaution below)
  3. Place the tube against a dark background and observe for immediate bubble formation (O2 + water = bubbles) at the end of the wooden applicator stick.
                            


                                                Performing The Catalase Test

  


INSTAGRAM

FACEBOOK
https://m.facebook.com/mikrobiyolojilab/