Microbiology Laboratory Turkey

Mikrobiyoloji Ile Ilgili Tüm Konuların Kısa ve Öz Anlatımları. Microbiology Lab Information.

Bu Blogda Ara(SEARCH)

MicroLab

virus etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
virus etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

15 Şubat 2019 Cuma

Şubat 15, 2019

Grip (Influenza) | Virüs

Grip (Influenza)

Solunum yoluna yerleşip daha çok kış aylarında salgın yapan, akut ve virütik bir enfeksiyon hastalığıdır. 2-3 yılda bir salgınlar yapar. Tüm dünyada yaş, cins ve ırk ayırımı gözetmeden görülür.

Etken ve Bulaşma Yolları 
Gribin etkeni RNA virüslerinden miksovirüs influenzadır. A, B, C, D serotipleri bulunur. A tipi insanlarda hastalık yapar. 
Kuluçka süresi 1-3 gündür. 
Ağız, burun, boğaz salgılarında bulunan virüsler, kolay ve hızla bulaşır. Etken, dış ortama dayanıklı değildir. Bulaşma direkt, damlacık ve hava yolu ile olur.

Klinik Belirtiler 
Etken epitel hücrelere girip toksinleriyle kana karışır. Klinik belirtileri ortaya çıkar. Üşüme, titreme ve ateşle başlar. Ateş (38 °C ve üzeri ) yükselir Hâlsizlik, kırgınlık, baş, kas, eklem ve sırt ağrıları belirtilerinin yanı sıra boğazda kuruluk, kızarıklık, ağrı ve yanma hissi oluşur. Çocuklarda bu duruma kusma ve ishal eşlik edebilir, küçük çocuklarda dikkat edilmesi gereken ek belirti huzursuzluk, iştahsızlık ve uyku halidir. Belirtiler hastanın günlük işlerini etkileyecek düzeye ulaşabilir.

Klinik Tanı 
Belirtilerinden dolayı diğer hastalıklarla karıştırılır. Çocuklarda, yaşlılarda, kalp, akciğer, böbrek, şeker hastalığı gibi kronik hastalığı olan kişilerde ağır seyreder. Ölümle sonuçlanabilir. Laboratuvar bulgusu; lenfositlerde azalma, eozinofillerin kaybolması ve lökopeni belirtileridir. 


Tedavi ve Bakım 
Gribin özel bir tedavisi yoktur. Hastanın vücut direncini artırıcı bol sıvı alması, C vitaminleri içeren taze meyve ve sularını tüketmesi, gerekirse yatak istirahati yapması gerekir. Doktor istemine gör uygun ilaçlar verilebilir. Hastanın kendini rahat hissetmesi ve komplikasyon gelişmesine yönelik hemşirelik bakımı yararlıdır. Odası sakin olmalı ve iyi havalandırılmalıdır. Oda ısısı 24 oC civarında ve nemli olmalıdır.

Komplikasyonlar 
Gripte şikâyetler genellikle 7 gün sürer, ilk 2-3 gün içerisinde şiddetlenir ve sonrasında düzelme başlar, ancak iyileşme süresi 1- 2 haftaya kadar da uzayabilir. Vücut direnci kırıldığı için, iyi bir bakım yapılmazsa ikincil enfeksiyonlara sebep olma ihtimali yüksektir. Pnömoni, bronkopnömoni, bronşit, menenjit, sinüzit, otitis media, myokardit, endokardit gibi komplikasyonlar görülür.

Korunma 
Sık değişim gösteren grip virüsüne karşı doğal bağışıklık bulunmamaktadır. Bağışıklık sistemi zayıf olan kişilerin, vücut dirençlerini arttırmak için aşı yaptırmaları gerekir. Hastalarla tokalaşma ve kucaklaşma gibi yakın temas kurulmamalıdır. Ayrıca kapalı alanlardan ve kalabalıklardan kaçınmak yararlı olur. Elleri gözler, ağız ve buruna dokundurmamak gibi önlemler gripten korunmada etkili olur. Hastaların da sağlamları korumak adına toplu yaşanılan alanlardan uzak durmaları, havlu gibi eşyalarını ayırmaları, yayılmanın önlenmesi açısından önemlidir. Hastaya bakan kişi, kişisel temizliğine özen göstermeli, ayrıca sık sık ılık tuzlu su ile ağız ve boğaz gargarası yapmalıdır. 


INSTAGRAM

4 Şubat 2019 Pazartesi

Şubat 04, 2019

Hepatitis C | HCV

Hepatitis C | HCV 

What is hepatitis C?

The hepatitis C (HCV) virus is spread through blood-to-blood contact and leads to inflammation of the liver. There is no vaccine to prevent HCV infection, however in many cases it can be cured.
Acute hepatitis C occurs when a person is infected with HCV for less than six months. One out of every three people infected clear the virus within six months. The others go on to have chronic hepatitis C.
The virus causes inflammation of the liver, which affects the way the liver works. The liver is an important organ that does many tasks essential for life and growth. If left untreated, HCV can result in a lot of scarring in the liver (cirrhosis), which stops the liver working properly. Liver damage can lead to liver cancer or liver failure.

What are the symptoms?

Many people with HCV have no symptoms. It is often referred to as a silent epidemic because people commonly don’t notice any symptoms until 20 or 30 years after infection. Any symptoms that do appear are usually mild and non-specific. The most common symptoms include:
  • Tiredness (fatigue)
  • Joint pain
  • Loss of appetite
  • Nausea
  • Abdominal pain.

How is hepatitis C spread?

Hepatitis C is spread through blood-to-blood contact. It is highly infectious and can survive outside the body for more than seven days. Those most at risk of HCV are people who:
  • Have injected drugs (even if only once)
  • Have received a tattoo or body piercing using unsterile equipment
  • Lived or received medical attention in a high-risk country (South East Asia, China, Eastern Europe (including Russia), or the Middle East)
  • Had a blood transfusion or received blood products prior to 1992
  • Have ever been in prison
  • Were born to a mother living with hepatitis C.

What tests are required to diagnose hepatitis C?

There are two blood tests needed to diagnose chronic hepatitis C.
  • Antibody test (anti-HCV) – Looks for antibodies and confirms whether you have ever been in contact with the hepatitis C virus. If this test if positive it doesn’t necessarily mean you are currently infected with hepatitis C, it means you have been infected at some point.
  • HCV RNA / hepatitis C antigen test – Confirms if the virus is present and whether you are infected.
  • Hepatitis C genotype test – HCV has six main sub-types. These sub-types or strains are called ‘genotypes’.

How to prevent infecting others?

Hepatitis C is spread through blood-to-blood contact. To avoid infecting others you should take the following steps:
  • Cover any open cuts or sores
  • Clean any blood spillage with household bleach (do not put bleach on your skin)
  • Avoid sexual practices which may risk blood contact
  • Do not share piercing, tattooing, drug injecting or snorting equipment
  • Do not donate blood
  • Do not share razors, towels, toothbrushes, or any object that may come into contact with blood.

Why is it important to be monitored?

Regular monitoring is important to assess the health of your liver. Blood tests can detect liver disease. If there is liver damage your GP can refer you to your local gastroenterology service for further assessment.

Who should I tell?

You do not have to tell anyone you have hepatitis, but you should take reasonable precautions to prevent the spread of the virus to others.
You may choose to share your diagnosis with particular people for support. It is often best to tell people you trust or people directly affected, such as household members or sexual partners.
Telling health care workers such as a doctor or nurse may be beneficial for good health care (e.g. prescribing the most appropriate medications). Health care workers, including dentists, are required to use standard infection control precautions for all situations and procedures that may involve exposure to blood or other bodily fluids, regardless of whether you have hepatitis or not.

Do I need to tell my employer? 

People living with hepatitis do not have to tell employers, unless you work in an environment that may put others at risk, such as healthcare. However, disclosure is not mandatory. Discrimination against people with hepatitis in the workplace is illegal.


INSTAGRAM

7 Ocak 2019 Pazartesi

Ocak 07, 2019

HIV (Human Immune Deficiency Virus / AIDS Virus)

HIV (Human Immune Deficiency Virus / AIDS Virus)


→ 80-120 nm in size, single-stranded, enveloped, RNA virus is a retrovirus included in the group.
→ Construction of DNA synthesis from RNA virus which has reverse transcriptase and integrase enzymes. HIV, constantly change the genetic structure because it is a retrovirus. 
→ Ultraviolet radiation-resistant, 70% alcohol, soap and water washing (0.5% hypochlorite) is sensitive. It dies at 15-20 minutes in a chlorinated pool water. 30 minutes in temperatures of 56oc is based. The virus is highly resistant in dry and lyophilized form. 

Antigenic Structure 
  • Core antigen (P24 antigens) and antigens used in serological tests important.  
  • Envelope antigens (gp160 antigens) is a glycoprotein structure. It consists of two parts.These free surface occurring gp120 (surface = SU), gp 41, is embedded in the surface and the membrane (transmembrane = TM) glycoproteins. HIV gp120 to receptors on the cell surface is involved in adhesion and fusion. 







HIV, AIDS (acquired human Immuno Deficiency Syndrome = acquired immunodeficiency syndrome) is the causative agent of the disease. 



Diagnostic Methods  
Review Samples
  • Serological analysis or virus must be Venous blood samples for determination routine.  
  • Peripheral blood mononuclear cells receiving the treated blood sample with heparin or EDTA are required for virus isolation. HIV also plasma, serum, CSF, saliva, tears, milk, urine, genital secretions also be isolated from infected tissues such as body fluids or samples. All kinds of clinical samples taken during the implementation process and should comply with standard precautions, gloves should be worn.  
  • Taken for serological testing plasma, serum and other body fluids should be kept at 200C or -700c. If the virus or viral antigen in the sample then the samples must be stored at -700c aranacaksa. 
  • If you get good results from Virus isolation is desired sample should be taken immediately after.  






Serology: 
Difficult when producing the virus in the culture, and reliable, most ELISA method is used for diagnosis in terms of results to be made quickly. Because while sometimes false positive screening test results obtained by ELISA for the detection of antibody western blot confirmatory test for a definitive diagnosis is made.

5 Ocak 2019 Cumartesi

Ocak 05, 2019

HIV (Human Immune Deficiency Virüs /AIDS Virüsü)

 HIV (Human Immune Deficiency Virüs /AIDS Virüsü)


→80-120 nm boyutlarında, tek iplikli, zarflı, retro virüs grubuna dâhil bir RNA virüsüdür.
→Yapısında RNA virüsünden DNA sentezi yapan revers transkriptaz ve integras enzimi bulunur. HIV, bir retro virüs olduğu için sürekli genetik yapısını değiştirir. 
→Ultraviole ışınlarına dirençli, % 70’lik alkol, sabun ve çamaşır suyuna (% 0,5 hipoklorit) duyarlıdır. Klorlanmış havuz suyunda 15-20 dakikada ölür. 56oC’deki sıcaklığa 30 dakika dayanır. Virüs, kuru ve liyofilize şekillerde oldukça dayanıklıdır. 



Antijenik Yapısı 
  • Çekirdek antijeni (p24 antijeni): Serolojik testlerde kullanılan önemli bir antijendir.  
  • Zarf antijeni (gp 160 antijeni): Glikoprotein yapısındadır. İki kısımdan oluşur. Bunlar yüzeyde serbest olarak bulunan gp 120 (surface = SU), yüzey ve membrana gömülü olarak bulunan gp 41 (transmembrane = TM ) glikoproteinleridir. Gp 120 HIV'in hücre yüzeyindeki reseptörlere tutunması ve birleşmesinde rol oynar. 





HIV, AIDS (acquired human ımmuno deficiency syndrome= kazanılmış bağışıklık yetmezliği sendromu) hastalığının etkenidir. 


Teşhis Yöntemleri  
İnceleme Örnekleri 
  • Serolojik analiz veya virüs saptanması için rutin olarak venöz kan örneği alınmalıdır.  
  • Periferik kan mononükleer hücrelerinde virüs izolasyonu için heparinli veya EDTA ile muamele edilmiş kan örneğinin alınması gereklidir. HIV ayrıca plazma, serum, BOS, tükürük, gözyaşı, süt, idrar, genital salgı gibi vücut sıvılarından veya infekte doku örneklerinden de izole edilir. Her türlü klinik örneğin alınmasında ve işlemin uygulanması sırasında standart önlemlere uyulmalı, eldiven giyilmelidir.  
  • Serolojik testler için alınan plazma, serum ve diğer vücut sıvıları 200C veya -700C’de saklanmalıdır. Eğer daha sonra örnekte virüs veya viral antijen aranacaksa örneklerin -700C’de saklanması gerekir. 
  • Virüs izolasyonundan iyi sonuç almak isteniyorsa örnek alındıktan hemen sonra çalışılmalıdır.  



Seroloji: 
Virüsün kültürde üretilmesi zor olduğundan ve güvenilir, çabuk sonuç alınması yönünden tanıda en fazla ELISA yöntemi kullanılır. ELISA ile antikorların tespitine yönelik tarama testi yapılırken bazen yalancı pozitif sonuçlar elde edildiğinden kesin teşhis için western blot doğrulama testi yapılır.




10 Aralık 2018 Pazartesi

Aralık 10, 2018

Adeno-Rota Virüs Testi

Adeno Rota Virüs Testi

Adenoid dokuda keşfedilen Adenovirüsler; faranjite, farma konjuktival ateşe ve zatürreye sebep olabilir. 5 yaşın altındaki çocuklarda görülen akut solunum hastalığının % 5'inden, bebeklerde görülen zatürrenin % 10'undan sorumludur. Akut gastroenterit olan çocuklarda bakılan gaitanın % 4-14'ünde Adenovirüs tespit edilmiştir.













Rotavirüs, çocuklarda görülen ishale en çok neden olan bir virüstür.  Virüs, ince bağırsağa yerleşerek, çok şiddetli ishal ve kusmayla ortaya çıkar. İleri derecede sıvı kaybı, böbrek yetmezliğine hatta ölümlere bile sebep olur. Özellikle pediatri kliniklerinde yayıldığında kontrol etmek zordur. Erken ve güvenilir tespit Rota virüslerin ileri enfeksiyonlarını önlemede büyük önem taşır.

Amaç 
Gaitada Adenovirüslerin ve/veya Rotavirüslerin kalitatif olarak tespit edilmesidir. 
Prensip 
Bu test, tek basamaklı immunokromotografik yan-akış testidir. Her iki virüse karşı yöneltilmiş monoklonal antikorlar kendi kendilerine Rota virüse özel; kırmızı ya da Adenovirüse özel; mavi lateks partiküllere karşı bağlanır. İki patojene karşı diğer özel antikorlar sıkıca membrana bağlanır. Gaita numunesi ekstrasyon bufer ile karıştırılıp çöktürülür. Temiz sıvı süpernatant test kasedi üzerine alınır. Numune antijene bağlı latex partikülle kasete geçer. Eğer test pozitif ise özel yakalama bandına bağlanır. 

Araç ve Gereçler 
  • Test kaseti 
  • Kullanıma hazır dilüent (Extrasyon bufer) 
  • Tek kullanımlık pipet  
  • Gaita süspansiyonu için test tüpleri 
  • Karıştırıcı 
  • % 0.5 sodyum hipoklorit solüsyonu içeren atık kabı 



Teknik 
  • 1 ml dilüent, test tüpüne konur. 
  • Gaitadan bir miktar alınıp dilüentin içine konur. 
  • Numune iyice homojen hale getirilir. Temiz bir süpernatant oluşana kadar 3 dakika beklenir. 
  • Test kasetleri, oda sıcaklığına getirilir. 
  • Test başlamadan hemen önce test kaseti, poşetinden çıkarılıp düz bir zemin üzerine yerleştirilir. 
  • Pipet ile 4 damla karışım kasetin numune gözüne (S harfi yazan bölüme) damlatılır. 
  • Cihazın numuneyi emmesi beklenir. 


Testin Değerlendirilmesi 
  • Test sonucu, 5 dakika sonra değerlendirilir. 
  • Sonuç penceresinde “C” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi yeşil ve “A” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi mavi renk Adenovirüs pozitifi gösterir. 
  • Sonuç penceresinde “C” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi yeşil ve “R” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi kırmızı renk Rotavirüs pozitifi gösterir. 
  • Sonuç penceresinde “C” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi yeşil, “A” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi mavi ve “R” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi kırmızı renk Adenovirüs ve Rotavirüs pozitifi gösterir.
  • Sonuç penceresinde “C” harfi üzerinde kalan bölümde yer alan tek çizgi yeşil, Adenovirüs ve Rotavirüs negatifi gösterir.
  • Test edilen gaita örneğinin fazla olması, sonuç penceresindeki üç bölümde de spesifik bant renklerinin yerine kahverengi rengin oluşmasına neden olur. (Bir anlamı yoktur, daha az miktarda gaita ile test tekrar edilmelidir.)
  • Hiçbir bantda herhangi bir renk görülmez ya da yukarıda tarif edilen, şekillerde gösterilen kombinasyonlardan farklı renkler olursa bir anlam ifade etmez ve değerlendirilmez.
  • Banttaki renk değişimi 10 dakika ya da daha sonra olursa bir anlam ifade etmez ve değerlendirilmez.

Testin Yapılışında Dikkat Edilmesi Gereken Kurallar 
  • Test kaseti 2-30 oC'de saklanabilir. Dondurulmamalıdır. 
  • Test kasetleri ve numune kullanmadan önce oda sıcaklığına getirilmelidir. 
  • Miadı geçen kasetler kullanılmamalıdır. 
  • Buffer solüsyonu sodyum azid içerdiğinden deriye temasından sakınılmalıdır. 
  • Numuneler eldiven giyilerek çalışılmalı ve test bittiği zaman eller yıkanmalıdır. 
  • Test çalışılırken sigara içilmez, herhangi bir şey yenilip içilmez. 
  • Gaita numuneleri hiçbir katkı maddesi olmayan temiz bir kaba konur.


  
INSTAGRAM