Microbiology Laboratory Turkey

Mikrobiyoloji Ile Ilgili Tüm Konuların Kısa ve Öz Anlatımları. Microbiology Lab Information.

Bu Blogda Ara(SEARCH)

MicroLab

gram negatif etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
gram negatif etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

7 Mart 2019 Perşembe

Mart 07, 2019

Brucella abortus (Brucellosis)

Brucella abortus

Brucella abortus hareketsiz, sporsuz, çoğunlukla kapsülsüz, gram negatif (-) koko-basildir.


Üreme Özellikleri
Brucella abortus, ilk kez üretildiğinde  % 10 CO2'e ihtiyaç duyar; birkaç pasajdan sonra CO2'siz aerob koşullarda üreyebilir. CO2'li ortamda üreyebilmesi, Brucella melitensis'ten ayıran önemli bir özelliktir. Bu nedenle Brucella abortus izolasyonu düşünülüyorsa besiyerlerinin desikatöre konması gerekir. Tiyoninli besiyerlerinde üremez; metil viyole, bazik fuksin gibi boyaların ilave edildiği besiyerlerinde ürer. Brucella melitensis'ten farklı olarak H2S'ü, iki gün gibi daha geç bir sürede meydana getirir. 

INSTAGRAM

0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , ,

7 Kasım 2018 Çarşamba

Kasım 07, 2018

Eijkman Testi

Eijkman Testi

Hayvanların bağırsağında bulunan Escherichia coli’nin tanısında, biyokimyasal idendifikasyon için saf kültürden Eijkman testi yapılır. Bakterinin tanımlanmasında Eijkman testinden daha çok İMVİC testi yapılır; sonuç (+ + - -) şeklinde çıkar yani Escherichia coli’de, indol testi (+), Metilen kırmızısı testi (+), Voges-Proskauer agar testi (-), sitrat testi (-)’dir.
0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , ,

29 Ekim 2018 Pazartesi

Ekim 29, 2018

CİTROBACTER TÜRKÇE

CİTROBACTER

Citrobacter türleri düzdür, fakültatif anaerobik, Gram-negatif basillerdir ve Enterobacteriaceae ailesindeki peritriköz flagella ve koliform bakteriler aracılığıyla tipik olarak hareketlidir. . Bu cins 1932'de Werkman ve Gillen tarafından önerilmiştir. 1993'ten önce sadece üç tür, Citrobacter freundii, Citrobacter koseri (Citrobacter diversus) ve Citrobacter amalonaticus kabul edildi. C. freundii bu cinsin tür cinsidir ve sonraki iki tür başka isimler olarak adlandırılmıştır. C. koseri, 1993 yılında Uluslararası Sistematik Bakteriyoloji Komisyonunun Yargı Komisyonu tarafından C. diversus'un yerini almıştır. Aynı yıl, Brenner ve ark. DNA hibridizasyonu ile 11 genomospesitasyona Citrobacter sınıflandırılmış: C.freundii, C.koseri, C. amalonaticus, C. farmeri, C. youngae, C. braakii, C. werkmanii, C. sedlakii ve isimsiz genomospecies 9, 10 ve 11. Daha sonra, genomospecies 9, 10 ve 11 C. rodentium, C. gillenii ve C. murliniae olarak adlandırıldı.
b5cc4c9ed36bbe9e0bf03030d1994435
Citrobacter freundii

Citrobacter türleri yaygın olarak suda, toprakta, gıdada ve hayvanların ve insanların bağırsaklarında bulunur. Birçok Citrobacter enfeksiyonları nozokomiyal olarak edinilir; bununla birlikte, aynı zamanda topluluk edinilmiş olabilirler. Geniş bir sürveyans çalışması, Gram-negatif enfeksiyonun% 0.8'inin Citrobacter spp. Hastane ayarlarında Citrobacter spp. Enterobacteriaceae'nin % 3 - 6'sını oluşturabilir nozokomiyal enfeksiyona neden olur. Citrobacter enfeksiyonları olan hastalarda, bakteriler anneden veya yatay olarak taşıyıcılardan veya diğer hastane kaynaklarından dikey olarak iletilebilir. Enfeksiyon sporadik vakalar veya nozokomiyal salgınlar olarak ortaya çıkabilir. Dikey veya nozokomiyal bulaşma, bazı sporadik olgularda bakterilerin kökenini ve aile üyeleri veya diğer kişiler için taşıyıcılar gibi taşıyıcılardan bulaşmayı açıklayabilir.

C0322124-Citrobacter_freundii% 252C_SEM


LABORATUVAR TANI
Citrobacter enfeksiyonu olan hastalar sadece kültür tarafından tanımlanabilir ve onaylanabilir. Citrobacter türleri çeşitli kültür ortamlarında büyüyebilir. Tüm türler , gaz üretimi ile Citrobacter ferment glikozu olarak tanımlanmıştır . Birkaç istisna dışında, organizmalar hareketlidir ve sitrat kullanırlar . Farklı türler biyokimyasal testlerle ayırt edilebilir . Antimikrobiyal duyarlılık testinin yorumu Enterobacteriaceae için kullanılan kriterleri takip eder .
875952355
Organizmalar, muhtemelen ağız boşluğunu, alt gastrointestinal sistemi veya solunum yolunu kolonize ederler. Daha sonra, bakteriyemi ve merkezi sinir sistemi (CNS) enfeksiyonu dahil olmak üzere çeşitli alanların enfeksiyonu ile sonuçlanabilir. Hastane dışı salgınlar büyük ölçüde hastane personeli tarafından gastrointestinal ve el taşımalarına bağlıdır.
CNS için C. koseri'nin özel eğilimi iyi anlaşılmamıştır. 32 kilodalton spesifik bir dış zar proteininin sinir dokularında bu organizmanın tropizmi ile ilişkili olduğu ve menenjit ve apseye neden olduğu ileri sürülmüştür.
877af4c03b2defc92fa745aa14a81baa
                            Citrobacter freundii on MacConkey



0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , ,

28 Ekim 2018 Pazar

Ekim 28, 2018

Citrobacter

CITROBACTER SPP.

Citrobacter species are straight, facultative anaerobic, Gram-negative bacilli and are typically motile by means of peritrichous flagellae and coliform bacteria in the Enterobacteriaceae family. This genus was proposed in 1932 by Werkman and Gillen. Before 1993, only three species, Citrobacter freundii, Citrobacter koseri (Citrobacter diversus), and Citrobacter amalonaticus, were recognized. C. freundii is the type species in this genus, and the later two species have been called other names. C. koseri was accepted to replace the name C. diversus by the Judicial Commission of the International Committee on Systematic Bacteriology in 1993. In the same year, Brenner et al. classified Citrobacter into 11 genomospecies by DNA hybridization: C.freundii, C.koseri, C. amalonaticus, C. farmeri, C. youngae, C. braakii, C. werkmanii, C. sedlakii, and unnamed genomospecies 9, 10 and 11. Later, genomospecies 9, 10 and 11 were named as C. rodentium, C. gillenii, and C. murliniae.
Citrobacter freundii

Citrobacter species are commonly found in water, soil, food, and the intestinal tracts of animals and humans. Many Citrobacter infections are nosocomially acquired; however, they can also be community acquired. A large surveillance study demonstrated that 0.8% of Gram-negative infection was caused by Citrobacter spp. In the hospital settings, Citrobacter spp. might account for 3 – 6% of all Enterobacteriaceae causing nosocomial infection.  In patient with Citrobacter infections, the bacteria can be transmitted vertically from mother or horizontally from carriers or other hospital sources. The infection may occur as sporadic cases or nosocomial outbreaks. Vertical or nosocomial transmission may account for the origin of bacteria in some sporadic cases, and transmission from carriers such as family members or other contacts accounts for others.



LABORATORY DIAGNOSIS
Patients with Citrobacter infection can be identified and confirmed only by culture. Citrobacter species can grow in various culture medium. All species identified as Citrobacter ferment glucose with production of gas. With few exceptions the organisms are motile and utilize citrate. Different species can be differentiated by biochemical tests. The interpretation of antimicrobial susceptibility testing follows the criteria used for Enterobacteriaceae.
GRAM STAINING



The organisms probably colonize the oral cavity, lower gastrointestinal tract, or respiratory tract first. Later it may result into infection of various sites, including bacteremia and central nervous system (CNS) infection. Nosocomial outbreaks are largely due to gastrointestinal and hand carriage by hospital personneln.
The particular propensity of C. koseri for CNS is not well understood. A specific outer-membrane protein of 32-kilodalton was proposed to be related to the tropism of this organism for nervous tissues and causing meningitis and abscesses.
Citrobacter freundii on MacConkey
0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , ,

27 Ekim 2018 Cumartesi

Ekim 27, 2018

Yersinia (Yersinia enterocolitica,Yersinia pestis)

YERSİNİA 
 (Yersinia enterocolitica,Yersinia pestis)


Enterobacteriaceae familyasının bir üyesi olan yersinia cinsinin insanlar için patojen olan 3 türü vardır. Bunlar; Yersinia pestis, Yersinia pseudotuberculosis ve Yersinia enterocolitica'dır. 
Yersinia
Yersinia enterocolitica 
 Yersinia enterocolitica koko basil görünümünde, sporsuz, kapsülsüz, 25oC'lik kültürlerinde hareketli iken 37oC'lik kültürlerde hareketsiz hale gelen, bu özelliği ile Yersinia pestis'ten ayrılan gram negatif (-) basildir. Kutupsal boyanma özelliği gösterir (uç kısımları koyu, ortaları daha açık boyanır). 

 Üreme Özellikleri 
Yersinia enterocolitica, aerob veya fakültatif anaerobdur. Optimal üreme ısı 25oC'dir. +4 oC 'de bile yavaş olarak üreyebilir. Kuruluk ve ısıya karşı dayanıksızdır. Safra tuzlu besiyerleri ve adi besiyerlerinde kolay ürer. Katı besiyerinde düzgün, hafif konveks 1-2mm çapında S tipi koloni yapar. Laktoz (-) olduğundan ENDO ve EMB agarda renksiz veya pembemsi, MacConkey'de renksiz veya sarımsı, deoksilat sitrat agarda saydam koloni oluşturur.  

Yersinia enterocolitica growing on C.I.N. Agar

Antijenik Özellikleri 
 Yersinia enterocolitica'da, O, H ve K antijenleri bulunur. 
Yaptığı Hastalıklar       
Gastroenterit, enterocolit, lenfadenit, faranjit, septisemi, artrit, purpura ve eritama gibi deri döküntülerine neden olur. 
Laboratuvar Teşhisi  
İnceleme örnekleri: Kan, idrar, ponksiyon sıvısı, gaita.
Teşhis Yöntemleri 
➤Kültür; MacConkey, ENDO, EMB agara direkt ekilebildiği gibi önce selenit-F besiyerine çift ekim yapılır; biri buzdolabına +4oC‟de, diğeri oda ısısında bekletilir. Oda ısısnda bekletilen, birkaç saat sonra ENDO, EMB, CIN agara ekilir. Buzdolabında bekletilen ise 7,17 ve 21. Günlerde Mac-Conkey ve CIN agara tek koloni ekimleri yapılarak kültürler izlenir. ➤Biyokimyasal testler; TSİ, Üre, IMViC testleri yapılır. 
➤Serolojik testler; hastalığın 2.ve 3.haftasından itibaren serolojik tesler yapılır.
GRAM BOYAMA
Yersinia pestis
Yersinia pestis hareketsiz, sporsuz, kapsülsüz, gram negatif (-) koko-basildir. Kutupsal boyanma özelliği gösterir. 
Üreme Özellikleri 
Yersinia pestis, aerob veya fakültatif anaerobdur. Optimal üreme ısısı 25-30 oC olmakla birlikte -2 ila 40 oC'de de üreyebilir. Kuruluk, ısı, gün ışığı ve dezenfektanlara dayanıksızdır. Organizma dışında kısa ürede ölür. Karanlıkta kalan pire dışkısında aylarca canlı kalır. Buyyonda ilk üremeleri yavaş olup bulanıklık yapmaz. Sonra dipte çöküntü oluşturur. Adi besiyerinde ve MacConkey'in safra tuzlu besiyerinde ürer. Jeloz ve jelatin üzerinde 48 saat sonra narin, saydam, ortasında yuvarlak, ince granüllü bir kısım bulunan koloniler yapar. İndol (-) dir. H2S yapar. Jelatini eritmez, hemoliz yapmaz.   
Antijenik Özellikleri 
 Yersinia pestis'in O antijeni bulunur.  
 Yaptığı Hastalıklar 
 Yersinia pestis, veba hastalığına neden olur.  
Laboratuvar Teşhisi  
İnceleme örnekleri: Lenf bezinden ponksiyonla alınan irin, kan, balgam. Örnekler çok bulaşıcı olduğundan vücut yüzeyi ve çevreye bulaştırmadan alınmasına özen gösterilmesi gerekir. 
➧Teşhis Yöntemleri 
➤Mikrobiyolojik örneğin direkt mikroskobik incelemesi; örnekten direkt preparat hazırlanıp gram boyasıyla boyanarak mikroskopta incelenir. 
➤Kültür; örnekler ENDO, MacConkey veya CIN agara (Cefsulodin-Irgasan-Novobiocin agar = BD Yersinia selektiveseçici agar; Yersinia enterocolitica'nın izolasyonu için seçici differansiyal bir besiyeri) ekilerek kesin tanı, kültürle konur. 

INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER

7
By on 7 yorum:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , , , ,

25 Ekim 2018 Perşembe

Ekim 25, 2018

PSEUDOMONAS (TÜRKÇE)

PSEUDOMONAS

Pseudomonas aeruginosa hareketli, sporsuz, kapsülsüz, gram (-) negatif basildir. Bazen çift çift, bazen de kısa zincirler halinde görünür. Çoğu kez bir ucunda tek, nadiren 2-3 kirpiği vardır ve çok hareketlidir. 

 Üreme Özellikleri  
Pseudomonas aeruginosa, aerob olmakla beraber anaerob üreyebilen türlerine de rastlanır. Optimal üreme ısısı 30-37oC‟dir. 42oC'de üreyebilmesi Pseudomonas aeruginosa için önemli bir özelliktir. Optimal pH'sı 7,2'dir. Hafif alkali ortamda bol ürer, kuruluğa fazla dirençli değildir; nemli güneşten uzak yerlerde, toprakta, yüzeysel sularda, yiyeceklerde, hastanelerde zemin ve aletler üzerine yerleşerek  uzun süre canlı kalır. Fırsatçı patojen olarak çeşitli hastalıklara yol açar. 

Adi besiyerinde üreyebilir; buyyonda yüzeyde zar yaparak bol ve homojen bir üreme gösterir; zarın hemen altında mavi-yeşil pigment oluşturur. Peptonlu suda da aynı şekilde ürer. Kanlı agarda hemoliz yapar. Hemoglobini tam olarak hemoliz ettiğinden kanlı agar besiyerindeki kolonilerin etrafında temiz ve berrak zon oluşturur. Pseudomonas aeruginosa kültürlerinde; inci beyazı koloni görüntüsü, tatlımsı aromatik meyve, menekşe, sabun gibi güzel kokusuyla tanınır. Pseudomonas aeruginosa piyosiyanin {mavi-yeşil), piyorubin (kırmızı-kahverengi) ve flöressein (yeşil-sarı ve flöresan) gibi pigmentler üretir. Flöresseini tüm Pseudomas türleri oluşturabilirken piyosiyanini, sadece Pseudomonas aeruginosa oluşturabilir. Bakterinin kesin tanısı, 42°C de üreme yetisi ve pigment üretiminin incelenmesiyle konur. Aerobik olmaları nedeni ile gıdaların yüzeyinde hızlı gelişebilmeleri sonucu okside ürünler ve mukoz madde oluşturur. Süt içinde de iyi ürer, sütün pıhtılaşmasında ve çıkardığı pigmentten dolayı sarı-yeşil renk almasına neden olur, laktoz (), H2S ve indol yapmaz, glikozda asit yapar, gaz yapmaz. 

 Antijenik Özellikleri 
Pseudomonas aeruginosa'da, O antijeni bulunur. Ayrıca H ve pilus antijenleri de saklanmıştır.  

Yaptığı Hastalıklar 
 Yara ve yanık enfeksiyonları, idrar yolu enfeksiyonları, menenjit, göz enfeksiyonları, bronşit ve bronkopnömoni, septisemi.    
GRAM STAINING


Laboratuvar Teşhisi   
İnceleme örnekleri: Kan, idrar, BOS, balgam, cerahat, yara ve yanık sürüntüleri.   
Teşhis Yöntemleri  
➤ Kültür; inceleme örnekleri, buyyon, adi jeloz, kanlı jeloz ve MacConkey gibi besiyerlerine ekilir. Saf kültürü elde edilir. 
➤ Biyokimyasal testler; biyokimyasal özellikleri değerlendirilerek teşhis edilir.  

OKSİDAZ TESTİ İÇİN TIKLAYIN
INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER


0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , ,
Ekim 25, 2018

PSEUDOMONAS

PSEUDOMONAS

Pseudomonas aeruginosa has become an important cause of infection, especially in patients with compromised host defense mechanisms. It is the most common pathogen isolated from patients who have been hospitalized longer than 1 week, and it is a frequent cause of nosocomial infections. Pseudomonal infections are complicated and can be life-threatening.

Signs and Symptoms
Pseudomonal infections can involve the following parts of the body, with corresponding symptoms and signs:
➤ Respiratory tract (eg, pneumonia)
➤ Bloodstream (bacteremia)
➤ Heart (endocarditis)
➤ CNS (eg, meningitis, brain abscess)
➤ Ear (eg, otitis externa and media)
➤ Eye (eg, bacterial keratitis, endophthalmitis)
➤ Bones and joints (eg, osteomyelitis)
➤ GI tract (eg, diarrhea, enteritis, enterocolitis)
➤ Urinary tract
➤ Skin

Physical findings depend on the site and nature of the infection, as follows:
➤ Endocarditis: Fever, murmur, and positive blood culture findings; peripheral stigmata such as Roth spots, Janeway lesions, Osler nodes, splinter hemorrhages, and splenomegaly
➤ Pneumonia: Rales, rhonchi, fever, cyanosis, retractions, and hypoxia; occasionally shock; with cystic fibrosis, clubbing, increased anteroposterior (AP) diameter, and malnutrition
➤ GI tract: Fever, signs of dehydration, abdominal distention, and signs of peritonitis; physical findings of Shanghai fever
➤ Skin and soft tissue infections: Hemorrhagic and necrotic lesions, with surrounding erythema; subcutaneous nodules, deep abscesses, cellulitis, and fasciitis; in burns, black or violaceous discoloration or eschar
➤ Skeletal infections: Local tenderness and a decreased range of motion; neurologic deficits
➤ Eye infections: Lid edema, conjunctival erythema and chemosis, and  evere mucopurulent discharge
➤ Malignant otitis externa: Erythematous, swollen, and inflamed external auditory canal; local lymphadenopathy
➤ Bacteremia: Fever, tachypnea, and tachycardia; hypotension and shock; jaundice 

>
Diagnosis
Laboratory studies that may be helpful include the following:
➨ Complete blood count (CBC)
➨ Blood cultures
➨ In urinary tract infection (UTI), urinalysis
➨ In pneumonia, culture of sputum and respiratory secretions, as well as blood gas analysis 
➨ Wound and burn cultures and cultures from other body fluids and secretions according to the clinical scenario
➨ Gram stain and culture of CSF if meningitis is suspected

➥Pseudomonas aeruginosa is member of the Gamma Proteobacteria class of Bacteria. It is aerobic bacterium belonging to the bacterial family Pseudomonadaceae. 

 GRAM Stain
Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative rod measuring 0.5 to 0.8 µm by 1.5 to 3.0 µm. Almost all strains are motile by means of a single polar flagellum.

Cultivation on Blood Agar
Pseudomonas aeruginosa has very simple nutritional requirements. It is often observed "growing in distilled water", which is evidence of its minimal nutritional needs. In the laboratory, the simplest medium for growth of Pseudomonas aeruginosa consists of acetate as a source of carbon and ammonium sulfate as a source of nitrogen.

P. aeruginosa isolates may produce three colony types. Natural isolates from soil or water typically produce a small, rough colony. Clinical samples, in general, yield one or another of two smooth colony types. One type has a fried-egg appearance which is large, smooth, with flat edges and an elevated appearance. Another type, frequently obtained from respiratory and urinary tract secretions, has a mucoid appearance, which is attributed to the production of alginate slime. The smooth and mucoid colonies are presumed to play a role in colonization and virulence.

The oxidase test is a biochemical reaction that assays for the presence of cytochrome oxidase, an enzyme sometimes called indophenol oxidase. In the presence of an organism that contains the cytochrome oxidase enzyme, the reduced colorless reagent becomes an oxidized colored product. The oxidase test often uses a reagent, tetra-methyl-p-phenylenediamine dihydrochloride (or KOVÁCS reagent), as an artificial electron donor for cytochrome c. When the reagent is oxidized by cytochrome c, it changes from colorless to a dark blue or purple compound, indophenol blue. There are many method variations to the oxidase test. These include, but are not limited to, the filter paper test, filter paper spot test, direct plate method, and test tube method.

INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER


0
By on Hiç yorum yok:
Etiketler: , , , , , , , , , , , , ,