Microbiology Laboratory Turkey

Mikrobiyoloji Ile Ilgili Tüm Konuların Kısa ve Öz Anlatımları. Microbiology Lab Information.

Bu Blogda Ara(SEARCH)

MicroLab

macconkey etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
macconkey etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

27 Ekim 2018 Cumartesi

Ekim 27, 2018

Yersinia (Yersinia enterocolitica,Yersinia pestis)

YERSİNİA 
 (Yersinia enterocolitica,Yersinia pestis)


Enterobacteriaceae familyasının bir üyesi olan yersinia cinsinin insanlar için patojen olan 3 türü vardır. Bunlar; Yersinia pestis, Yersinia pseudotuberculosis ve Yersinia enterocolitica'dır. 
Yersinia
Yersinia enterocolitica 
 Yersinia enterocolitica koko basil görünümünde, sporsuz, kapsülsüz, 25oC'lik kültürlerinde hareketli iken 37oC'lik kültürlerde hareketsiz hale gelen, bu özelliği ile Yersinia pestis'ten ayrılan gram negatif (-) basildir. Kutupsal boyanma özelliği gösterir (uç kısımları koyu, ortaları daha açık boyanır). 

Üreme Özellikleri 
Yersinia enterocolitica, aerob veya fakültatif anaerobdur. Optimal üreme ısı 25oC'dir. +4 oC 'de bile yavaş olarak üreyebilir. Kuruluk ve ısıya karşı dayanıksızdır. Safra tuzlu besiyerleri ve adi besiyerlerinde kolay ürer. Katı besiyerinde düzgün, hafif konveks 1-2mm çapında S tipi koloni yapar. Laktoz (-) olduğundan ENDO ve EMB agarda renksiz veya pembemsi, MacConkey'de renksiz veya sarımsı, deoksilat sitrat agarda saydam koloni oluşturur.  

Yersinia enterocolitica growing on C.I.N. Agar

Antijenik Özellikleri 
 Yersinia enterocolitica'da, O, H ve K antijenleri bulunur. 
Yaptığı Hastalıklar       
Gastroenterit, enterocolit, lenfadenit, faranjit, septisemi, artrit, purpura ve eritama gibi deri döküntülerine neden olur. 
Laboratuvar Teşhisi  
İnceleme örnekleri: Kan, idrar, ponksiyon sıvısı, gaita.
Teşhis Yöntemleri 
➤Kültür; MacConkey, ENDO, EMB agara direkt ekilebildiği gibi önce selenit-F besiyerine çift ekim yapılır; biri buzdolabına +4oC‟de, diğeri oda ısısında bekletilir. Oda ısısnda bekletilen, birkaç saat sonra ENDO, EMB, CIN agara ekilir. Buzdolabında bekletilen ise 7,17 ve 21. Günlerde Mac-Conkey ve CIN agara tek koloni ekimleri yapılarak kültürler izlenir. ➤Biyokimyasal testler; TSİ, Üre, IMViC testleri yapılır. 
➤Serolojik testler; hastalığın 2.ve 3.haftasından itibaren serolojik tesler yapılır.
GRAM BOYAMA
Yersinia pestis
Yersinia pestis hareketsiz, sporsuz, kapsülsüz, gram negatif (-) koko-basildir. Kutupsal boyanma özelliği gösterir. 
Üreme Özellikleri 
Yersinia pestis, aerob veya fakültatif anaerobdur. Optimal üreme ısısı 25-30 oC olmakla birlikte -2 ila 40 oC'de de üreyebilir. Kuruluk, ısı, gün ışığı ve dezenfektanlara dayanıksızdır. Organizma dışında kısa ürede ölür. Karanlıkta kalan pire dışkısında aylarca canlı kalır. Buyyonda ilk üremeleri yavaş olup bulanıklık yapmaz. Sonra dipte çöküntü oluşturur. Adi besiyerinde ve MacConkey'in safra tuzlu besiyerinde ürer. Jeloz ve jelatin üzerinde 48 saat sonra narin, saydam, ortasında yuvarlak, ince granüllü bir kısım bulunan koloniler yapar. İndol (-) dir. H2S yapar. Jelatini eritmez, hemoliz yapmaz.   
Antijenik Özellikleri 
 Yersinia pestis'in O antijeni bulunur.  
 Yaptığı Hastalıklar 
 Yersinia pestis, veba hastalığına neden olur.  
Laboratuvar Teşhisi  
İnceleme örnekleri: Lenf bezinden ponksiyonla alınan irin, kan, balgam. Örnekler çok bulaşıcı olduğundan vücut yüzeyi ve çevreye bulaştırmadan alınmasına özen gösterilmesi gerekir. 
➧Teşhis Yöntemleri 
➤Mikrobiyolojik örneğin direkt mikroskobik incelemesi; örnekten direkt preparat hazırlanıp gram boyasıyla boyanarak mikroskopta incelenir. 
➤Kültür; örnekler ENDO, MacConkey veya CIN agara (Cefsulodin-Irgasan-Novobiocin agar = BD Yersinia selektiveseçici agar; Yersinia enterocolitica'nın izolasyonu için seçici differansiyal bir besiyeri) ekilerek kesin tanı, kültürle konur. 

INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER

21 Ekim 2018 Pazar

Ekim 21, 2018

ENTEROBACTER SPP. (TÜRKÇE)

ENTEROBACTER SPP.

İnsanlarda hastalık oluşturan başlıca Enterobacter türleri  şunlardır: 
➧ Enterobacter aerogenes, 
➧ Enterobacter cloaecea. 
Enterobacter hareketli, sporsuz, çoğunlukla kapsülsüz veya ince kapsüllü, gram negatif (-) basildir. 


Üreme Özellikleri 
Entorebacter, MacConkey ve endo agarda pembe; EMB agarda morumsu koloniler  yaparak ürer. Ayrıca sitratlı ve KCN'li besiyerlerinde ürer. TSİ besiyerinde üremeleri Klebsiella gibidir. Klebsiellalardan başlıca farkları, hareketli ve çoğu kez kapsülsüz olmalarıdır. Manitolü fermente eder. Başta glikoz olmak üzere şekerleri asit ve gaz meydana getirerek parçalar. Nişastadan gaz meydana getirmemesi, ayırt edici özelliğidir. 

ENTEROBACTER on MACCONKEY AGAR

Antijenik Özellikleri 
Enterobacterler belirgin O ve H, bazende K antijenleri bulunur. 

Yaptığı Hastalıklar 
Enterobacter, normal insan bağırsak florasında bulunabilir. Ancak  bağışıklığı zayıflamış prematüre, yaşlı kimseler ile immun yetmezlik, immün baskılanma ve yanık gibi durumlarda fırsatçı patojen olarak idrar yolları, üst solunum, yara, yanık enfeksiyonları ile septisemi ve menenjit oluşturabilir. 

Laboratuvar Teşhisi  
Escherichia coli'de olduğu gibidir. 


INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER

16 Ekim 2018 Salı

Ekim 16, 2018

KLEBSIELLA SPP.

KLEBSIELLA

The genus Klebsiella consists of non-motile, aerobic and facultatively anaerobic, Gram negative rods. At the time of writing, the genus Klebsiella comprises K. pneumoniae subsp. pneumoniae, K. pneumoniae subsp.ozaenae, K. pneumoniae subsp. rhinoscleromatis, K. oxytoca, K. ornithinolytica, K. planticola, and K. terrigena. However, comparison of the sequences of each species shows that the genus is heterogeneous, and may be more reasonably arranged in three clusters. Cluster 1 contains the three subspecies of  K. pneumoniae, cluster 3 contains K. oxytoca and cluster 2 contains the other species (which are notable for growth at 10° C and utilization of L-sorbose as a carbon source). It has been proposed that the genus Klebsiella be divided into two genera and one genogroup, with the name Raoultella being the genus name for those organisms in cluster 2.

For the purpose of conforming to current clinical usage, the clinically important species and subspecies will be referred to as K. pneumoniae, K. ozaenae, K. rhinoscleromatis and K. oxytoca in this chapter.

KLEBSIELLA ON MACCONKEY AGAR

LABORATORY DIAGNOSIS

The members of the genus Klebsiella are Gram negative, nonmotile, facultative anaerobic rods ranging from 0.3 to 1.0 μm in width to 0.6-6.0 μm in length. Most strains grown readily on standard media, although occasionally cysteine requiring urinary isolates of K. pneumoniae are encountered. These strains will appear as pinpoint colonies on routine media, and require supplementation of media with cysteine for more adequate growth. The vast majority of Klebsiella spp. are encapsulated - contrary to popular belief it is probably not capsule which primarily contributes to the mucoid appearance that some Klebsiella strains exhibit.  The Klebsiella which has been linked to the invasive syndrome presenting as liver abscess have a mucoid appearance.

In practice, K. pneumoniae and K. oxytoca are distinguished by indole production by K. oxytoca but not K. pneumoniae. It should be noted however that K. ornitholytica is also an indole producer. The five clinically important species can be distinguished by tests for indole production, ornithine decarboxylase production, he Voges-Proskauer reaction, malonate utilization and o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside (ONPG) production.

KLEBSIELLA ON BLOOD AGAR


Production of plasmid-mediated extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) by Klebsiella spp. has become a major problem. The nature and characteristics of ESBLs are described in greater detail below. Detection of ESBLs in clinical isolates of Klebsiella spp. is problematic since a significant proportion of ESBL producing isolates appear susceptible to third generation cephalosporins or aztreonam. Yet, poor clinical outcomes have been observed when these same antibiotics have been used to treat serious infections due to apparently susceptible ESBL producers. A single surrogate marker for ESBL production, such as ceftazidime resistance, is insufficient for the detection of ESBLs. Virtually all reliable laboratory tests used for detection of ESBLs rely on the change in in vitro activity of oxyimino containing beta-lactams in the presence of a beta-lactamase inhibitor such as clavulanic acid. Examples of ESBL detection methods include the double disk diffusion test, Etest strips containing ceftazidime or cefotaxime with and without clavulanic acid, the Vitek ESBL detection card and the Microscan ESBL plus detection system. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) has also developed screening and confirmatory tests for detection of ESBLs. It should be noted that these are standardized for K. pneumoniae and K. oxytoca only.


In some circumstances there is a need to detect ESBL producing Klebsiella spp. from stool or rectal swabs. Examples of such media include Drigalski agar supplemented with cefotaxime 0.5 mg/L , MacConkey agar supplemented with ceftazimide 4 mg/L and nutrient agar supplemented with ceftazimide 2 mg/L, vancomycin 5 mg/L and amphotericin B 1667 mg/L.


INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER

15 Ekim 2018 Pazartesi

Ekim 15, 2018

MACCONKEY AGAR (TÜRKÇE)

MacConkey Agar

MacConkey Agar, laktozu fermente etmeyen bakteriler ve koliformların biribirinden ayrımı için önerilen, gram pozitif bakterilerin inhibisyonunu sağlayan seçici besiyeridir.

MacConkey (MAC) agar, klinik materyallerin bir çoğundan elde edilen aerop veya fakültatif aerop  gram negatif basillerin kültürü için selektif ve ayırıcı bir besiyeridir ; MAC agar: protein, safra  tuzları, NaCL, Iaktoz, agar ve iki boya ihtiva eder. MAC agarın selektif etkisi kristal viyole ve safra  tuzlarına bağlıdır. Bunlar birçok gram pozitif bakteri türlerini inhibe eder. Gram negatifler ise  genellikle bu besiyerinde iyi ürer ve laktoz fermentasyonlarına göre tiplendirilirler. Laktoz  fermentasyonu yapanlar kırmızı-pembe koloniler yapar ve asid nedeniyle çöken safraya bağlı bir  zonla çevrilidir. Kırmızı, renk laktozdan asid oluşumu, nötral kırmızısının absorbsiyonu vs nihayet  ortamın pH' ı 6.8 in altına düştüğünde meydana gelen renk değişimi sonuçlarında husule gelir.  
Laktoz fermentasyonu yapmayan Salmonella ve Shigella gibi türler renksiz ve saydam koloniler  yapar. Tipik olarak ortamın rengi değişmez. Yersinia enterocolitica oda ısısında inkübe edilirse  küçük, laktoz fermentasyonu yapmayan koloniler oluşturur. E. coli MacConkey agarda laktozu  parçalayıp 44°C'de gaz teşkil eder. Böylece dışkıda E. coli suşlarının diğer koliforrn bakterilerden  ayrımı sağlanır. Kristal viyole koymadan hazırlanan MacConkey besiyerinde Mycobacteria'da ürer.



14 Ekim 2018 Pazar

Ekim 14, 2018

MacConkey Agar

MacConkey Agar

MacConkey agar is both selective and differential. It contains bile salts and the dye crystal violet, which inhibit the growth of gram-positive bacteria and select for gram-negative bacteria. It also contains the carbohydrate lactose, which allows differentiation of gram-negative bacteria based on their ability to ferment lactose.  Organisms which ferment lactose produce acid end-products which react with the pH indicator neutral red, and produce a pink color.



Quadrant 1:  Growth on the plate indicates the organism, Enterobacter aerogenes, is not inhibited by bile salts and crystal violet and is a gram-negative bacterium.  The pink color of the bacterial growth indicates E.aerogenes is able to ferment lactose.

Quadrant 2:  Growth on the plate indicates the organism, Escherichia coli, is not inhibited by bile salts and crystal violet and is a gram-negative bacterium.  The pink color of the bacterial growth indicates E.coli is able to ferment lactose.

Quadrant 3: Absence of growth indicates the organism, Staphylococcus epidermidis, is inhibited by bile salts and crystal violet and is a gram-positive bacterium.

Quadrant 4:  Growth on the plate indicates the organism, Salmonella typhimurium, is not inhibited by bile salts and crystal violet and is a gram-negative bacterium.  The absence of color in the bacterial growth indicates S. typhimurium  is unable to ferment lactose.



INSTAGRAM
FACEBOOK 
TWITTER